Repositório de tecido humano e análise de tecido

O Repositório de Tecidos Humanos e Análise de Tecidos (HTR-TA), um recurso compartilhado, é apoiado e gerenciado em conjunto pelo Centro Abrangente de Câncer da UNM e pelo Departamento de Patologia. O recurso compartilhado HTR-TA é certificado pelo Colégio Americano de Patologistas (CAP).

O recurso compartilhado HTR-TA foi criado para facilitar a pesquisa translacional do corpo docente do Centro de Câncer da UNM, do Departamento de Patologia, da Faculdade de Medicina e de outros institutos. Este site descreve os serviços oferecidos e os dados de contato dos membros da equipe do recurso compartilhado HTR-TA que podem aconselhar sobre a disponibilidade de espécimes e todos os aspectos da histologia e patologia molecular.

Propósito

O Recurso Compartilhado de Repositório de Tecidos Humanos e Análise de Tecidos (HTR-TA) oferece suporte à pesquisa básica e translacional sobre câncer, fornecendo aos usuários amostras de tumores e tecidos normais correspondentes, congelados ou fixados em formalina e incluídos em parafina (FFPE).

Sobre o recurso compartilhado HTR-TA

O Recurso Compartilhado HTR-TA:

  • Beneficia futuros pacientes, permitindo aos pesquisadores o acesso a tecidos bem preservados e mantidos que poderiam não estar disponíveis
  • Beneficia o HSC da UNM ao fortalecer a missão de fornecer atendimento de qualidade ao paciente por meio da promoção de pesquisas inovadoras e clinicamente valiosas
  • A função de corretor honesto do recurso compartilhado HTR-TA na distribuição de espécimes não identificados, desprovidos dos 18 identificadores pessoais HIPAA, protege os pesquisadores de potenciais complicações/violações da HIPAA.

O recurso compartilhado HTR-TA oferece diversos serviços essenciais de histologia , incluindo:

  • processamento de tecidos e inclusão em parafina,
  • seccionamento,
  • Coloração H&E,
  • iimagens imuno-histoquímicas e digitais, e
  • análise de seções coradas, além de armazenamento e liberação de amostras de tecido.

Os tecidos são coletados mediante obtenção do consentimento adequado. Eles são mantidos em um banco de dados que também contém informações vinculadas sobre o paciente (por exemplo, nome, data de nascimento e categorias demográficas autoidentificadas), origem e diagnóstico do tecido, além de outras variáveis, incluindo o método de coleta do tecido, o tempo de isquemia e como o tecido foi processado após o recebimento pelo HTR-TA.

Atualmente, o HTR-TA abriga mais de 60,000 bioespécimes, com mais de 20,000 congelados e mais de 17,000 bioespécimes FFPE e mais de 7,000 amostras de sangue (sangue total, soro, plasma e células congeladas e criopreservadas).

A coleção de tecidos HTR-TA reflete as populações dentro da área de influência da UNMCCC.

Resumo dos serviços de recursos compartilhados do HTR-TA para solicitações de subsídios

O Recurso Compartilhado de Repositório de Tecidos Humanos e Análise de Tecidos (HTR-TA) tem a capacidade de executar diversas técnicas e oferece uma variedade de serviços mediante pagamento por serviço.

O recurso compartilhado HTR-TA coleta tecidos normais e tumorais correspondentes, principalmente de espécimes cirúrgicos descartados e descartados, e os armazena congelados ou em blocos fixados em formalina e incluídos em parafina (FFPE). Os pesquisadores podem solicitar os tecidos, mediante aprovação do IRB (Human Research Protections Office) e do Comitê de Revisão Científica (SRC).

O recurso compartilhado HTR-TA também pode fornecer uma série de serviços histológicos e moleculares diferentes, como seccionamento e coloração H&E, imuno-histoquímica e imunofluorescência usando a plataforma Ventana Discovery Ultra, criação de microarrays de tecido personalizados (TMAs), digitalização de lâminas (campo claro) por meio do Aperio AT2 e análise de imagens usando a plataforma HALO™ (da Indica Labs, sede em Albuquerque, Novo México).

Vários tipos de processamento de sangue estão disponíveis, incluindo desempenho de contagem de células e viabilidade por meio do Nexelom Cellometer 1000.

Alguns pesquisadores exigem espécimes especialmente preparados ou têm requisitos específicos para espécimes. Para esses estudos aprovados, a equipe de recursos compartilhados do HTR-TA coletará os espécimes prospectivamente e os processará de acordo com as necessidades dos pesquisadores. Uma reunião de viabilidade deve ser agendada com o Gerente Técnico para discutir os serviços desejados.

Para reconhecer o uso deste recurso compartilhado, inclua o seguinte em suas publicações:

Esta pesquisa foi parcialmente apoiada pelo UNM Comprehensive Cancer Center Support Grant NCI P30CA118100 e fez uso do Human Tissue Repository & Tissue Analysis Shared Resource, que recebe apoio adicional do Departamento de Patologia da Faculdade de Medicina da Universidade do Novo México.

Entre em contato com o recurso compartilhado HTR-TA

Telefone: (505) 272-1127
E-mail: tissuebank@salud.unm.edu
Salas Fitz Hall 306B e 306C
Faculdade de Medicina UNM HSC
Departamento de Patologia
MSC08-4640
915 Caminho da Saúde, NE
Albuquerque, NM 87131

Padrões de Repositório e Acreditação

No recurso compartilhado HTR-TA da UNM, estamos comprometidos em manter os mais altos padrões em gestão de bioespécimes, garantia de qualidade e supervisão ética. Nossas operações seguem diretrizes rigorosas e as melhores práticas estabelecidas por importantes organizações nacionais e internacionais:

  • Instituto Nacional do Câncer (NCI) – Ramo de Pesquisa em Biorepositórios e Bioespécimes (BBRB)
    Nós aderimos ao BBBB Melhores práticas para recursos de bioespécimes, que fornecem orientação abrangente sobre a coleta, processamento, armazenamento e distribuição de espécimes biológicos para garantir consistência e integridade científica.
    https://biospecimens.cancer.gov/default.asp
  • Sociedade Internacional de Repositórios Biológicos e Ambientais (ISBER)
    HTR alinha-se com o ISBER Melhores práticas para repositórios, uma estrutura reconhecida internacionalmente para a gestão e governança de biorrepositórios que dão suporte à pesquisa em ciências biológicas e ambientais.
    https://www.isber.org/page/BPR
  • College of American Pathologists (CAP) – Programa de Acreditação de Biorepositórios
    A HTR tem orgulho de ser credenciada pela CAP por meio de seu Programa de Credenciamento de Biorepositórios, que valida nossa conformidade com os padrões líderes do setor em qualidade de bioespécimes, rastreabilidade e excelência operacional.
    https://www.cap.org/laboratory-improvement/accreditation/biorepository-accreditation-program

Esses padrões garantem que nossos bioespécimes e serviços apoiem pesquisas reprodutíveis e de alta qualidade e contribuam significativamente para os avanços na ciência do câncer e no atendimento ao paciente.

Pessoal de recursos compartilhados HTR-TA

joste-nancy-cc.jpgNancy Joste, MD

Professor e Presidente, Departamento de Patologia

Diretor Médico

Supervisiona os aspectos de controle de qualidade do Recurso

Cathleen Martinez, PDCatleen Martinez PA

Gerente Técnico

Supervisiona os aspectos técnicos do Recurso

Fred Schultz, MAFred Schultz, MA

Gestão Informática

Serviços de histologia e patologia molecular

Processamento de tecidos e inclusão em parafina e seccionamento em parafina, bem como congelamento rápido de tecido e seccionamento congelado. Coloração H&E em parafina e cortes congelados.

O laboratório pode colorir seções de tecido com anticorpos padrão usando protocolos já existentes. Como alternativa, o laboratório pode trabalhar com anticorpos usando a plataforma VENTANA DISCOVERY, que permite várias combinações de coloração para otimizar os resultados da coloração.

Imagem HER-2 e ER
Coloração dupla para HER-2 e ER
HTR Tissue Microarrays - e-caderina

Projeto e construção de microarray de tecido: Isso envolve a coleta de blocos de parafina de doadores, a seleção das áreas de interesse para o núcleo e a colocação dos núcleos em um bloco de parafina recipiente em branco. As vantagens estão na velocidade e no custo, pois várias amostras podem ser avaliadas em uma lâmina. O TMA típico contém aproximadamente 50 a 200 núcleos de 0.6 mm-2.0 mm de diâmetro. Aproximadamente 50 seções podem ser obtidas a partir de um bloco TMA.

 

(À direita: E-caderina)

O pessoal de recursos compartilhados do HTR-TA pode recuperar blocos de tecido arquivados no Hospital UNM.

Isso geralmente consiste na coleta de tecidos excedentes ou remanescentes no momento da ressecção cirúrgica, após a coleta de amostras diagnósticas para análise microscópica pelo patologista cirúrgico e a retenção de amostras suficientes em parafina para possíveis testes futuros para o cuidado do paciente. A equipe de recursos compartilhados do HTR-TA coletará os tecidos na Sala de Dissecção Macroscópica do Centro de Patologia Cirúrgica do HSC da UNM. Atualmente, o recurso compartilhado do HTR-TA não realiza punções venosas, mas armazenará as amostras conforme solicitado pelos pesquisadores.

 Os consultores de projetos de recursos compartilhados do HTR-TA podem coletar dados clínicos e de patologia que são desprovidos de identificadores HIPAA, mas codificados para amostras correspondentes.

Análise de imagem

Imagens de H&E ou seções de tecido coradas imuno-histoquimicamente são capturadas no scanner digital Leica AT2 e carregadas no software de imagem e anotação HALO.

O software HALO permite que você anote o tecido (tumor, estroma, músculo, gordura etc.) e, em seguida, conte as células que são positivas para a proteína de escolha (Figura, à direita) dentro de cada uma dessas regiões anotadas. Ele também permitirá que você analise e quantifique as interações do vizinho mais próximo.

O software inclui uma ferramenta de criação de figuras que pode criar fotos de vários painéis de imagens em formatos publicáveis, incluindo quadros de referência e barra de escala

Imagem de resultados quantitativos

Esta figura mostra a quantificação da coloração para Ki67 no câncer de mama. O painel superior esquerdo mostra a amostra de microarray de tecido, o painel do meio mostra a coloração Ki67 (marrom) sem a marcação HALO e o painel direito mostra a mesma imagem com a marcação HALO.

A marcação mostra coloração de baixo nível (amarelo), coloração moderada (marrom) e altos níveis (vermelho) de Ki67 no núcleo das células tumorais. A coloração azul são células negativas para Ki67. O software pode contar independentemente a coloração de Ki67 no estoma do tumor.

A tabela mostra uma leitura do número e porcentagem de células em cada categoria de coloração e o histograma mostra a distribuição da coloração.

Como se inscrever para espécimes

Entre em contato com Cathy Martinez para agendar.

Abra sua conta no iLab:

  1. Navegue até a página de login do iLabs.
  2. No canto superior direito da tela, selecione registe-se
  3. Preencha o formulário na página de inscrição. Para configuração da conta iLab ou problemas de acesso, entre em contato. Palakshi Reddy Bandapalli ou 505-272-4539.
  4. Receba um e-mail de boas-vindas do iLab com credenciais de login e instruções

Solicitando serviços no iLab:

  1. Vou ao Login iLabs Disputas de Comerciais.
  2. No canto superior direito desta página, digite seu nome de usuário e senha.
  3. Na aba “Solicitar Serviços”, clique em “Iniciar Solicitação”.
  4. Preencha o formulário e forneça informações de pagamento para sua solicitação antes de enviá-la ao recurso compartilhado HTR-TA.
    1. Certifique-se de que o título do projeto e os números SRC/HRRC/IACUC correspondem aos das suas cartas de aprovação.
    2. Em cada categoria de serviços, insira o número desejado e clique na guia “Adicionar serviços selecionados”. Os serviços serão adicionados na parte inferior do formulário.
    3. Use a caixa “Informações adicionais” para adicionar quaisquer detalhes importantes e anexe / carregue quaisquer documentos relevantes, como uma lista de espécimes ou descrição de orientação.
  5. As solicitações ficarão pendentes de análise pelo recurso compartilhado do HTR-TA, que fará as alterações necessárias e as enviará de volta para sua aprovação. Você receberá um e-mail do iLab sobre a atualização da sua solicitação de projeto.
Para usar espécimes previamente armazenados:
  1. Envie sua proposta ao Comitê de Revisão Científica (SRC). Contato Ernestine Armijo para orientação neste processo.
  2. Preencha o requerimento do SRC (HRP-224), com todas as assinaturas necessárias e envie ao SRC.
  3. Assim que o SRC aprovar sua proposta, envie a carta de aprovação com sua inscrição para a UNM Comitê de Revisão de Pesquisa Humana (HRRC) Comitê de Revisão Institucional (IRB).

Para navegar no processo de inscrição do IRB:

  1. No link acima, clique no botão “irb.health.unm.edu” na parte inferior da página.
  2. Clique na guia IRB na parte superior da tela
  3. Clique no botão “Criar Novo Estudo” à esquerda
  4. Preencha o formulário
  5. Na pergunta nº 7, clique no link "Biblioteca IRB" e selecione o protocolo apropriado para seu estudo.
    1. Se o seu estudo exigir apenas materiais não identificados, selecione o Protocolo de Categoria 4 Isento (HRP-582). *Observação: Tecidos descartados não identificados podem não exigir consentimento.
    2. Se o seu estudo não exigir a obtenção de nenhuma informação sobre indivíduos vivos, selecione Nonhuman Subject Research (HRP-585)
    3. Você pode enviar para um envio rápido se o seu estudo envolver apenas amostras que foram coletadas exclusivamente para fins não relacionados à pesquisa (como tratamento médico e diagnóstico)
  6. Se precisar de ajuda para navegar no processo de inscrição do IRB ou para identificar qual protocolo atende melhor às necessidades do seu projeto, por favor contato Ernestine Armijo para obter assistência.

Após a aprovação do HRRC, envie uma solicitação de tecido ao recurso compartilhado HTR-TA por meio do iLab. Você precisará enviar suas cartas de aprovação do SRC e do IRB e enviar uma Requisição de Compra (PR) ativa.

Navegando no iLab:

  1. Navegue até a página de login do iLabs.
  2. No canto superior direito da tela, selecione registe-se
  3. Preencha o formulário na página de inscrição. Para configuração da conta iLab ou problemas de acesso, entre em contato. Palakshi Reddy Bandapalli ou 505-272-4539.
  4. Receba um e-mail de boas-vindas do iLab com credenciais de login e instruções

Solicitando serviços no iLab:

  1. Vou ao Login iLabs Disputas de Comerciais.
  2. No canto superior direito da página, clique em “Entrar” e digite o nome de usuário e a senha.
  3. Na aba “Solicitações de serviço”, clique em “iniciar solicitação” ao lado de Solicitação de serviço de compartilhamento de recursos do repositório de tecidos humanos e análise de tecidos.
  4. Preencha o formulário, incluindo o upload das cartas de aprovação SRC/IRB/IACUC apropriadas e selecione o Número de RP no menu suspenso. Clique em "Enviar solicitação".
  5. O status da solicitação ficará pendente de análise pelo HTR. As alterações necessárias serão feitas e enviadas de volta para aprovação.
  6. E-mails do iLab informarão o status do projeto.
  1. Entre em contato com o recurso compartilhado HTR-TA para uma sessão de planejamento/viabilidade.
  2. Envie sua proposta ao Comitê de Revisão Científica (SRC). Contato Ernestine Armijo para obter orientação sobre este processo.
  3. Assim que o SRC aprovar sua proposta, envie a carta de aprovação com sua inscrição ao Conselho de Revisão Institucional (IRB) do Comitê de Revisão de Pesquisa Humana da UNM (HRRC) (veja as instruções acima).
  4. Entre em contato com o recurso compartilhado HTR-TA para uma sessão de planejamento adicional (geralmente necessária para esclarecer detalhes do processo). Esta reunião inclui a obtenção da aprovação do Chefe da Divisão de Patologia Cirúrgica para garantir a disponibilidade dos espécimes, mantendo a conformidade com os regulamentos nacionais de laboratório e o melhor atendimento ao paciente.
  5. Caso ainda haja tecido após o encerramento da investigação, você deverá devolvê-lo ao recurso compartilhado do HTR-TA.
  1. Você deve obter a aprovação do Comitê de Revisão de Pesquisa em Seres Humanos local se qualquer porção do tecido coletado puder ser potencialmente usada para pesquisa.
  2. O Chefe da Divisão de Patologia Cirúrgica ou seu representante deve aprovar o método de coleta de amostra para garantir que tecido representativo suficiente seja retido para cuidados clínicos

Estoque

Local de tecidos coletados

(Inclui tecido de arquivo da UNM e coleção prospectiva para investigadores de estudos específicos.)

  • Bexiga, sangue, osso, medula óssea, cérebro, mama
  • Parede torácica, colorretal
  • Diafragma
  • Vesícula biliar
  • Cabeça e pescoço
  • Rim
  • Fígado, pulmão, linfonodo
  • Mediastino
  • Omento, Ovário
  • Pâncreas, pênis, peritônio, próstata
  • Saliva, glândula salivar, pele, intestino delgado, tecido mole, baço, estômago
  • Testículo, timo, tireóide
  • Útero e colo do útero
  • Vagina / Vulva

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Registro expandido de câncer de mama (EBCR)

Esta é uma coleção complicada de tecido que consiste em mais de 400 pacientes consentidos com vários pontos no tempo e tipos de tecido coletados. O seguinte foi coletado em cada paciente:

  • Máximo de 5 alíquotas de soro / participante / coleta (como linha de base ou tempo FUP)
  • Máximo de 10 alíquotas de plasma / participante / coleta
  • 10 alíquotas de DNA de sangue total / participante / coleta
  • 2 alíquotas de DNA máximas de bochechos ou cotonete / participante / coleta
  • tecido mamário (aspirados com agulha fina, frascos e moldes de OCT) - todos os casos são diferentes.

Para obter informações mais detalhadas sobre este conjunto de dados, entre em contato com o recurso compartilhado HTR-TA .