Repositório de tecido humano e análise de tecido

O Repositório de Tecido Humano e o Recurso Compartilhado de Análise de Tecido (HTR-TASR) são financiados conjuntamente pelo Cancer Center e pelo Departamento de Patologia. Eles foram criados para facilitar a pesquisa translacional do corpo docente do Cancer Center, do Departamento de Patologia, da Escola de Medicina e de todos os institutos. Este site descreve os serviços oferecidos e os detalhes de contato dos membros da equipe do HTR-TASR que podem aconselhar sobre a disponibilidade de amostras e todos os aspectos da histologia e patologia molecular.

Propósito

Facilitar a aquisição, armazenamento e distribuição de amostras de tecido humano de alta qualidade para pesquisadores da UNM para uso em investigações científicas, observando os princípios e regulamentos éticos, científicos e legislativos apropriados.

Usamos o Práticas recomendadas do NCI para recursos bioespecíficos como nosso guia.

Sobre HTR-Tissue

O recurso compartilhado HTR-Tissue:

  • Beneficia futuros pacientes, permitindo aos pesquisadores o acesso a tecidos bem preservados e mantidos que poderiam não estar disponíveis
  • Beneficia o HSC da UNM ao fortalecer a missão de fornecer atendimento de qualidade ao paciente por meio da promoção de pesquisas inovadoras e clinicamente valiosas
  • A função de corretor honesto do HTR na distribuição de amostras não identificadas, sem os 18 identificadores pessoais HIPAA, protege os pesquisadores de complicações / violações potenciais da HIPAA

O TASR fornece uma variedade de serviços de histologia, incluindo processamento e inclusão em parafina, parafina e seccionamento congelado, coloração H&E, coloração IHC, construção TMA, digitalização de lâminas e análise de imagens.

Resumo dos serviços HTR-TASR para solicitações de doações

O Repositório de Tecido Humano e Recurso Compartilhado de Análise de Tecido (HTR-TASR) tem a capacidade de executar uma série de técnicas e oferece uma variedade de serviços com base em uma taxa por serviço.

O HTR-TASR coleta tecido normal e tumoral correspondente, principalmente de espécimes cirúrgicos descartados, e os armazena congelados ou como blocos fixados em formalina e incluídos em parafina (FFPE). Os investigadores podem solicitar os tecidos, com as aprovações exigidas do IRB (Human Research Protections Office) e do Tissue Research Oversight Committee (TROC, antigo SRC).

O HTR-TASR também pode fornecer uma série de serviços histológicos e moleculares diferentes, como corte e coloração H&E, imunohistoquímica e imunofluorescência usando a plataforma Ventana Discovery Ultra, criação de Tissue Microarrays (TMAs) personalizados, digitalização de lâminas (campo claro e fluorescente) via o Aperio Versa 200, e análise de imagem usando a plataforma HALO ™ (da Indica Labs, sede em Albuquerque, NM).

Vários tipos de processamento de sangue estão disponíveis, incluindo desempenho de contagem de células e viabilidade por meio do Nexelom Cellometer 1000.

Alguns investigadores requerem espécimes especialmente preparados ou têm requisitos específicos de espécimes. Para esses estudos aprovados, a equipe do HTR coletará prospectivamente as amostras e processará de acordo com as necessidades dos pesquisadores. Além disso, alguns serviços moleculares estão disponíveis, como extração de DNA e RNA, PCR e PCR em tempo real. Uma reunião de viabilidade deve ser marcada com o gerente técnico e o gerente de operações para discutir os serviços desejados.

Para reconhecer o uso deste recurso compartilhado, inclua o seguinte em suas publicações:

Esta pesquisa foi parcialmente financiada pelo UNM Comprehensive Cancer Center Support Grant NCI P30CA118100 e fez uso do Repositório de Tecido Humano e do Recurso Compartilhado de Análise de Tecido, que recebe apoio adicional do Departamento de Patologia da Escola de Medicina da Universidade do Novo México.

Contato HTR-Tissue

Telefone: (505) 272-1127
E-mail: tissuebank@salud.unm.edu
Salas Fitz Hall 306B e 306C
Faculdade de Medicina UNM HSC
Departamento de Patologia
MSC08-4640
915 Caminho da Saúde, NE
Albuquerque, NM 87131

Pessoal HTR-TA

Dennis McCance, PhDDennis J McCance PhD

Professor Pesquisador, Patologia

Diretor científico

Supervisiona todos os aspectos do Recurso

Edgar Fischer, MDEdgar Fischer

Professor, Patologia

Diretor Médico

Supervisiona os aspectos de controle de qualidade do Recurso

Cathleen Martinez, PDCatleen Martinez PA

Gerente Técnico

Supervisiona os aspectos técnicos do Recurso

Sadie La Bauve, PhDSadie La Bauve PhD

Especialista operacional

Gerencia as responsabilidades do dia a dia

Fred Schultz, MAFred Schultz, MA

Gestão Informática

Serviços de histologia e patologia molecular

Processamento de tecido e inclusão em parafina ou congelamento instantâneo de tecido. O tecido pode ser tingido com uma coloração H&E ou permanecer sem coloração.

O laboratório pode colorir seções de tecido com anticorpos padrão usando protocolos já existentes. Como alternativa, o laboratório pode trabalhar com anticorpos usando a plataforma VENTANA DISCOVERY, que permite várias combinações de coloração para otimizar os resultados da coloração.

Imagem HER-2 e ER
Coloração dupla para HER-2 e ER
HTR Tissue Microarrays - e-caderina

Projeto e construção de microarray de tecido: Isso envolve a coleta de blocos de parafina de doadores, a seleção das áreas de interesse para o núcleo e a colocação dos núcleos em um bloco de parafina recipiente em branco. As vantagens estão na velocidade e no custo, pois várias amostras podem ser avaliadas em uma lâmina. O TMA típico contém aproximadamente 50 a 200 núcleos de 0.6 mm-2.0 mm de diâmetro. Aproximadamente 50 seções podem ser obtidas a partir de um bloco TMA.

 

(À direita: E-caderina)

O pessoal do HTR-TASR pode recuperar blocos de tecido de arquivo do Hospital UNM.

Isso geralmente compreende a coleta de tecidos em excesso ou remanescentes no momento da ressecção cirúrgica após as amostras diagnósticas terem sido coletadas para revisão microscópica do patologista cirúrgico e amostra suficiente ser retida em parafina para possíveis testes futuros para atendimento ao paciente. A equipe do HTR-TASR irá coletar os tecidos na sala de dissecção macroscópica do UNM HSC Surgical Pathology. Atualmente, o HTR não realiza punções venosas, mas armazenará tais amostras conforme solicitado pelos pesquisadores.

Os consultores do projeto HTR-TASR podem coletar dados patológicos e clínicos que são despojados de identificadores HIPAA enquanto codificados para amostras correspondentes.

Análise de imagem

Imagens de H&E ou seções de tecido coradas imuno-histoquimicamente são capturadas no scanner digital Leica AT2 e carregadas no software de imagem e anotação HALO.

O software HALO permite que você anote o tecido (tumor, estroma, músculo, gordura etc.) e, em seguida, conte as células que são positivas para a proteína de escolha (Figura, à direita) dentro de cada uma dessas regiões anotadas. Ele também permitirá que você analise e quantifique as interações do vizinho mais próximo.

O software inclui uma ferramenta de criação de figuras que pode criar fotos de vários painéis de imagens em formatos publicáveis, incluindo quadros de referência e barra de escala

Imagem de resultados quantitativos

Esta figura mostra a quantificação da coloração para Ki67 no câncer de mama. O painel superior esquerdo mostra a amostra de microarray de tecido, o painel do meio mostra a coloração Ki67 (marrom) sem a marcação HALO e o painel direito mostra a mesma imagem com a marcação HALO.

A marcação mostra coloração de baixo nível (amarelo), coloração moderada (marrom) e altos níveis (vermelho) de Ki67 no núcleo das células tumorais. A coloração azul são células negativas para Ki67. O software pode contar independentemente a coloração de Ki67 no estoma do tumor.

A tabela mostra uma leitura do número e porcentagem de células em cada categoria de coloração e o histograma mostra a distribuição da coloração.

Como se inscrever para espécimes

Contato Cathy Martinez or Sadie LaBauve agendar.

Abra sua conta no iLab:

  1. Navegue até a página de login do iLabs.
  2. No canto superior direito da tela, selecione se inscrever
  3. Preencha o formulário de registro na página de inscrição.
  4. Receba um e-mail de boas-vindas do iLab com credenciais de login e instruções

Solicitando serviços no iLab:

  1. Estabeleça uma Requisição de Compra (PR) por meio de seu departamento. Envie o PR para Maria Sherman solicitando que seja adicionado ao seu laboratório no sistema iLab.
  2. Vou ao Login iLabs Disputas de Comerciais.
  3. No canto superior direito desta página, digite seu nome de usuário e senha.
  4. Na guia “Solicitar serviços”, clique em “Iniciar solicitação” ao lado do serviço de interesse (Human Tissue Repository vs Molecular Pathology Services).
  5. Preencha o formulário e forneça as informações de pagamento de sua solicitação antes de enviá-la ao HTR.
    1. Certifique-se de que o título do projeto e os números do TROC / HRRC / IACUC correspondam aos das cartas de aprovação.
    2. Em cada categoria de serviços, insira o número desejado e clique na guia “Adicionar serviços selecionados”. Os serviços serão adicionados na parte inferior do formulário.
    3. Use a caixa “Informações adicionais” para adicionar quaisquer detalhes importantes e anexe / carregue quaisquer documentos relevantes, como uma lista de espécimes ou descrição de orientação.
  6. As solicitações ficarão com revisão pendente pelo HTR, que fará as alterações necessárias e as enviará de volta para sua aprovação. Você receberá um e-mail do iLab sobre a atualização de sua solicitação de projeto.
  1. Envie sua proposta ao Comitê de Supervisão de Pesquisa de Tecidos (TROC). Contato Cassandra Misenar para orientação neste processo.
  2. Assim que o TROC aprovar a sua proposta, envie a carta de aprovação com a sua candidatura ao UNM Comitê de Revisão de Pesquisa Humana (HRRC) Comitê de Revisão Institucional (IRB).

Para navegar no processo de inscrição do IRB:

  1. No link acima, clique no botão “Click IRB” à esquerda
  2. Clique na guia IRB na parte superior da tela
  3. Clique no botão “Criar Novo Estudo” à esquerda
  4. Preencha o formulário
  5. Na pergunta nº 7, clique no link para ir à biblioteca e selecione o protocolo apropriado para o seu estudo
    1. Se o seu estudo requer apenas materiais não identificados, selecione o Protocolo de Isenção da Categoria 4 (HRP-582). * Observação: os tecidos descartados não identificados podem não exigir consentimento
    2. Se o seu estudo não exigir a obtenção de nenhuma informação sobre indivíduos vivos, selecione Nonhuman Subject Research (HRP-585)
    3. Você pode enviar para um envio rápido se o seu estudo envolver apenas amostras que foram coletadas exclusivamente para fins não relacionados à pesquisa (como tratamento médico e diagnóstico)
  6. Após a aprovação do HRRC, envie uma solicitação de tecido ao HTR por meio do iLab. Você fará o upload de suas cartas de aprovação de SRC e IRB e terá um PR ativo no sistema.
  1. Contate o HTR-TASR para uma sessão de planejamento / viabilidade.
  2. Envie sua proposta ao Comitê de Supervisão de Pesquisa de Tecidos (TROC). Contato Cassandra Misenar para obter orientação sobre este processo.
  3. Assim que o TROC aprovar a sua proposta, envie a carta de aprovação com a sua candidatura ao Conselho de Revisão Institucional (IRB) do Comité de Revisão de Investigação em Seres Humanos da UNM (HRRC) (ver instruções acima).
  4. Entre em contato com o HTR-TASR para uma sessão de planejamento adicional (geralmente necessária para esclarecer os detalhes do processo. Esta reunião inclui a obtenção da aprovação do Chefe da Divisão de Patologia Cirúrgica para garantir a disponibilidade das amostras, mantendo a conformidade com os regulamentos laboratoriais nacionais e o melhor atendimento ao paciente.
  5. Se houver tecido remanescente após o encerramento de sua investigação, você deve devolvê-lo ao HTR
  1. Você deve obter a aprovação do Comitê de Revisão de Pesquisa em Seres Humanos local se qualquer porção do tecido coletado puder ser potencialmente usada para pesquisa.
  2. O Chefe da Divisão de Patologia Cirúrgica ou seu representante deve aprovar o método de coleta de amostra para garantir que tecido representativo suficiente seja retido para cuidados clínicos

Estoque

Local de tecidos coletados

(Inclui tecido de arquivo da UNM e coleção prospectiva para investigadores de estudos específicos.)

  • Bexiga, sangue, osso, medula óssea, cérebro, mama
  • Parede torácica, colorretal
  • Diafragma
  • Vesícula biliar
  • Cabeça e pescoço
  • Rim
  • Fígado, pulmão, linfonodo
  • Mediastino
  • Omento, Ovário
  • Pâncreas, pênis, peritônio, próstata
  • Saliva, glândula salivar, pele, intestino delgado, tecido mole, baço, estômago
  • Testículo, timo, tireóide
  • Útero e colo do útero
  • Vagina / Vulva

Registro expandido de câncer de mama (EBCR)

Esta é uma coleção complicada de tecido que consiste em mais de 400 pacientes consentidos com vários pontos no tempo e tipos de tecido coletados. O seguinte foi coletado em cada paciente:

  • Máximo de 5 alíquotas de soro / participante / coleta (como linha de base ou tempo FUP)
  • Máximo de 10 alíquotas de plasma / participante / coleta
  • 10 alíquotas de DNA de sangue total / participante / coleta
  • 2 alíquotas de DNA máximas de bochechos ou cotonete / participante / coleta
  • tecido mamário (aspirados com agulha fina, frascos e moldes de OCT) - todos os casos são diferentes.

Entre em contato com o HTR-TASR para uma consulta mais detalhada deste conjunto de dados.